More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4325 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1654 aa  3442    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
1714 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
3706 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
1676 aa  337  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  32.57 
 
 
1182 aa  326  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
2693 aa  325  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
1093 aa  317  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
1093 aa  317  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
1390 aa  308  4.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.56 
 
 
1248 aa  289  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.78 
 
 
1210 aa  284  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 
1501 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.16 
 
 
783 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.79 
 
 
945 aa  272  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.62 
 
 
1561 aa  271  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
1344 aa  266  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
980 aa  262  5.0000000000000005e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
815 aa  258  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.06 
 
 
744 aa  258  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
964 aa  258  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
771 aa  252  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
1927 aa  241  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 
488 aa  235  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
767 aa  234  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
572 aa  232  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
1026 aa  230  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.54 
 
 
1239 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
613 aa  230  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.01 
 
 
1432 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  28.48 
 
 
936 aa  229  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  24.91 
 
 
1289 aa  228  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
1205 aa  228  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
1246 aa  222  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.31 
 
 
819 aa  220  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
991 aa  218  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
439 aa  215  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.9 
 
 
892 aa  214  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  26.22 
 
 
886 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
839 aa  214  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
1273 aa  212  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
1330 aa  210  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
681 aa  210  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
526 aa  207  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
971 aa  207  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
909 aa  207  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
1053 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
941 aa  205  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
1253 aa  204  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.51 
 
 
1047 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  28.33 
 
 
754 aa  202  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 
1148 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
1560 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  27.39 
 
 
746 aa  198  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
1183 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 
215 aa  197  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
1057 aa  196  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 
732 aa  195  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
1076 aa  194  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
932 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
1177 aa  194  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.76 
 
 
1081 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.41 
 
 
1668 aa  191  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
547 aa  191  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
764 aa  191  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
1227 aa  190  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1428 aa  190  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  42.41 
 
 
1663 aa  189  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  32.89 
 
 
449 aa  189  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
1118 aa  189  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  31.19 
 
 
492 aa  188  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.74 
 
 
1791 aa  186  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
912 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1820 aa  184  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
674 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1965 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  27.59 
 
 
918 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
890 aa  183  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
462 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
551 aa  182  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
913 aa  182  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  37.32 
 
 
682 aa  181  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
382 aa  181  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
1977 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 
1134 aa  181  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 
723 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
945 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  31.21 
 
 
704 aa  179  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
1122 aa  178  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
524 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 
1669 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0662  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
918 aa  177  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0359693 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
924 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
347 aa  178  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
1009 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
545 aa  177  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
1051 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
1051 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
872 aa  176  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 
585 aa  175  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
1051 aa  174  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>