More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3509 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 439 aa  890    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 488 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 1654 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 3706 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 681 aa  202  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 1093 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 1093 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 815 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 613 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 771 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  37.05 
 
 		 783 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 964 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 1560 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 839 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1676 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  45.37 
 
 		 744 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 1714 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 936 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 1253 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 912 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 1239 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 2693 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 1390 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 1177 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 526 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 872 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  47.55 
 
 		 1668 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 723 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.83 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 945 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 551 aa  169  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 767 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 1047 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  46.08 
 
 		 1663 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  55.56 
 
 		 951 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 1246 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 782 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 732 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 932 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 941 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 991 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 657 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 878 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 913 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 1051 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 790 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1210 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 674 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 856 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  33.14 
 
 		 1248 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 834 aa  160  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 886 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 746 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 909 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 739 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 215 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 771 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 1051 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 1183 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 764 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 752 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 732 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 945 aa  152  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  36.09 
 
 		 1182 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  34.85 
 
 		 754 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 892 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  39.25 
 
 		 1289 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 774 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 788 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  35.98 
 
 		 676 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 1093 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 980 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 757 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 631 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 704 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 832 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 979 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  33.48 
 
 		 918 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 746 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  57.26 
 
 		 857 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 747 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 698 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  40.19 
 
 		 657 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 749 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 532 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  46.21 
 
 		 554 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  31.65 
 
 		 812 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>