More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4308 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 739 aa  1519    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 782 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 747 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 746 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 856 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 698 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 774 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 832 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 752 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 757 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 813 aa  300  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 807 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 749 aa  260  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 771 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 732 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 437 aa  237  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 756 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 272 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 1654 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 572 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 681 aa  158  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  40.4 
 
 		 744 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 693 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 1714 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 964 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 1093 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 1093 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 3706 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 648 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 834 aa  145  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 771 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 382 aa  144  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 872 aa  144  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 1676 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 723 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 2693 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 991 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 1093 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 767 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 613 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  36.95 
 
 		 754 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1177 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  37.96 
 
 		 783 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 524 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 941 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 815 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 732 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 362 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 788 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 1560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 945 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 215 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 1390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  36.41 
 
 		 1182 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.67 
 
 		 1668 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 631 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 1239 aa  134  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.22 
 
 		 1663 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  34.39 
 
 		 918 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  35.35 
 
 		 1289 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  33.49 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 347 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 406 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1246 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 1051 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 1253 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 878 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 1183 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 547 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 913 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 363 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 674 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 932 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 532 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 909 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 886 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 362 aa  125  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 362 aa  124  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 360 aa  124  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 1047 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1210 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 980 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  33.33 
 
 		 800 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.94 
 
 		 381 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  30.77 
 
 		 650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  33.59 
 
 		 624 aa  121  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 400 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 381 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 472 aa  121  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 361 aa  121  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>