More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4331 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 545 aa  1093    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 547 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.38 
 
 		 668 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.38 
 
 		 668 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 1654 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  35.01 
 
 		 663 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 695 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 771 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  53.42 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 708 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 882 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 572 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 369 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 468 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 1239 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 498 aa  147  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 1177 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 1676 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 526 aa  146  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4169  ATPase domain-containing protein  53.54 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0180001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4682  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.33 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4538  histidine kinase  53.54 
 
 		 417 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1210 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 1390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 1714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.25 
 
 		 744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 964 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  33.03 
 
 		 387 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1253 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 739 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1182 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 872 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 945 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1650  sensory box protein  42.95 
 
 		 819 aa  134  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00487383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 1051 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 788 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 682 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 815 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 886 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.21 
 
 		 783 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 767 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  31.16 
 
 		 366 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 334 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 366 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 1246 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 215 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0662  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 918 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0359693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  25.98 
 
 		 754 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 381 aa  128  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.59 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.29 
 
 		 1248 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 790 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 1051 aa  127  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 704 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 1093 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 945 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 3706 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1093 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1093 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 941 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 746 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 991 aa  124  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 631 aa  123  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 723 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 892 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 2693 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 746 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 362 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 771 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 492 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  27.68 
 
 		 411 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0693  Signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 782 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 774 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 347 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 657 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  28.11 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 909 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 839 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 681 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 834 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 362 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 757 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 749 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 355 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>