More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2086 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 756 aa  1565    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 813 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 782 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 739 aa  208  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 807 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 774 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 749 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 752 aa  187  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 698 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 856 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 746 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 757 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 832 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 747 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 437 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 771 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 347 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 1714 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 215 aa  131  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 3706 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 572 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 1654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 382 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 272 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 681 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 526 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 834 aa  125  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 1183 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 991 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 1253 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 980 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 872 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 932 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 941 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1047 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 1390 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 2693 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1182 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 945 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 1246 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 551 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  31.51 
 
 		 449 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 1093 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.25 
 
 		 783 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  29.41 
 
 		 918 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  32.02 
 
 		 1248 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 1227 aa  114  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 704 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 886 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 764 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 545 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 603 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 964 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 1676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 1560 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  30.05 
 
 		 744 aa  112  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 815 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 674 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.65 
 
 		 1663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 682 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 657 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  28.01 
 
 		 624 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 648 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 1239 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 839 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 511 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 1093 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 1093 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.27 
 
 		 1668 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 1177 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 732 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1289 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 693 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 788 aa  108  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 913 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 532 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 492 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  28.44 
 
 		 754 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 771 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 909 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 767 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 723 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 350 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 350 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1051 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 631 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 912 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  31.05 
 
 		 344 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  27.91 
 
 		 657 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  29.25 
 
 		 800 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 790 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 488 aa  101  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 924 aa  101  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 365 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 936 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>