More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5382 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 511 aa  1035    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 532 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 681 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 1253 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 807 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 648 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 1093 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 991 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 1239 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 749 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 1093 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 631 aa  114  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 1093 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1714 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 756 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 1227 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.88 
 
 		 783 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 603 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 1654 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  27.36 
 
 		 449 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 3706 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 764 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3963  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 541 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.14 
 
 		 744 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 813 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 771 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 932 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 600 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 945 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 886 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 674 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1560 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 1676 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.17 
 
 		 1663 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  30 
 
 		 800 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  29.46 
 
 		 754 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 872 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 215 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 572 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.17 
 
 		 1668 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 739 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 834 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 1177 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 746 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 746 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 1047 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 693 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 839 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 2693 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3214  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 752 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.11 
 
 		 918 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 964 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 348 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1182 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  32.29 
 
 		 624 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 913 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  29.5 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 1246 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.34 
 
 		 1248 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 819 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 657 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 771 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 1051 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 878 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 757 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 294 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 871 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 545 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 492 aa  97.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 747 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 909 aa  97.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.86 
 
 		 348 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 400 aa  96.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  96.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 272 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 815 aa  96.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 732 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 856 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1289 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 1051 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 437 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 1390 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 524 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 348 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 585 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>