More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2265 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 365 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  75.41 
 
 		 366 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  74.59 
 
 		 366 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  70.03 
 
 		 368 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 317 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 878 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 1654 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 1239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1253 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 681 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 2693 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1246 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 347 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 551 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1714 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 788 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 991 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 526 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 1390 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 815 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 941 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 839 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 932 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 3706 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1093 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1093 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 613 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 732 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 215 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 572 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  28.97 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 872 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  27.27 
 
 		 744 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 547 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 756 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 439 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 674 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 648 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 1560 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 1177 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 771 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.12 
 
 		 783 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 964 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 472 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 497 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 693 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  29.96 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  23.82 
 
 		 945 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 272 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  25.93 
 
 		 657 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 545 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 437 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 909 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 813 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 1676 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 462 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 913 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 782 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 980 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 631 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1173  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 240 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171534  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 764 aa  90.1  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.84 
 
 		 1668 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  31.39 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 382 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 807 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 493 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 924 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 1227 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 495 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 524 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 739 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  27.15 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 626 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 520 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 532 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 856 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 936 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 749 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  25.88 
 
 		 754 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 1093 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  26.74 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  30.15 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  27.8 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>