More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11268 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  100 
 
 		 624 aa  1262    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  33.4 
 
 		 650 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 1560 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 782 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 1093 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 693 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 764 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 815 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 1714 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 964 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 215 aa  143  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  38.81 
 
 		 754 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  40.38 
 
 		 744 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 771 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 681 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 774 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 1093 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 913 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 856 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  37.98 
 
 		 783 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  37.76 
 
 		 918 aa  136  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 1093 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 347 aa  134  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 752 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 1253 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  37.26 
 
 		 1239 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 813 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 807 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 878 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 3706 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 1654 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1051 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 872 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1177 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 746 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 437 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 991 aa  127  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 790 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 682 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 488 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 704 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 932 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 771 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 674 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 912 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 2693 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 1047 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 547 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 732 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  37.2 
 
 		 1248 aa  124  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 572 aa  124  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 945 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 551 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 1183 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 747 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 1051 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 1390 aa  122  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 941 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 362 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 362 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 532 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.48 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 892 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 723 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 1227 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1289 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1676 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 936 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 788 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.5 
 
 		 1668 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  36.32 
 
 		 657 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 698 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 600 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 834 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 980 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1210 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 739 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 1246 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 909 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  35.27 
 
 		 1182 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 832 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  35.94 
 
 		 800 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 886 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.5 
 
 		 1663 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 739 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 382 aa  113  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 819 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 360 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 363 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 945 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 756 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>