More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1629 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 600 aa  1242    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 648 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  31.27 
 
 		 624 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 774 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 1253 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 698 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 1093 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 813 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 1654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 1093 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 782 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 721 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 526 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 1560 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 991 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  26.99 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 551 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.63 
 
 		 754 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 693 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 709 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 1093 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 892 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 746 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 215 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 834 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 771 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 547 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1714 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 856 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 757 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 807 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.17 
 
 		 744 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  48.03 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  32.6 
 
 		 657 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 2693 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 358 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 815 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 732 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 941 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 945 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 1390 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 767 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 1047 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 1676 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 747 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 964 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 771 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 756 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 752 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 1177 aa  100  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 912 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 3706 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  29.33 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 1051 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 924 aa  99.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 681 aa  99.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1182 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  30.93 
 
 		 918 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 420 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.16 
 
 		 783 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 682 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  29.91 
 
 		 676 aa  97.8  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 727 aa  97.8  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 1239 aa  97.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 788 aa  97.8  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1183 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 472 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 764 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 878 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 886 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 585 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 674 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 406 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 387 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  33.64 
 
 		 1248 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 749 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 398 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 839 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 550 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 872 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 1051 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 739 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 932 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 945 aa  94.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 416 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 704 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1210 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 657 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 382 aa  93.2  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1289 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 344 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.24 
 
 		 381 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>