More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0589 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  71.99 
 
 		 616 aa  713    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 550 aa  1076    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  72.34 
 
 		 541 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1177 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  39.82 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 547 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 381 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 1390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  35.1 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 945 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 1253 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 732 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 215 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 613 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 453 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 3706 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 771 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  28.74 
 
 		 1055 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 767 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 1051 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 872 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 834 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0636  diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  24.78 
 
 		 918 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 551 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1093 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 1093 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.1 
 
 		 1668 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 839 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 864 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 874 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  23.36 
 
 		 487 aa  103  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  28.28 
 
 		 744 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 875 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 1654 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.31 
 
 		 895 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 1714 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 764 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 1560 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 871 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 674 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 400 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 488 aa  100  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.78 
 
 		 1663 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 1676 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 980 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 681 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.98 
 
 		 754 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.27 
 
 		 783 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 532 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 941 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.98 
 
 		 1239 aa  97.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 420 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  29.9 
 
 		 624 aa  97.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 878 aa  97.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 964 aa  97.1  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 991 aa  97.1  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 757 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 912 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 1183 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 1093 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 771 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 662 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  33.05 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 366 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 886 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1210 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 334 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 439 aa  95.9  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  27.02 
 
 		 556 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 497 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 1211 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 492 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 739 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 815 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 600 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  26.97 
 
 		 800 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 924 aa  94.7  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 572 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1182 aa  94  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 361 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 932 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 462 aa  93.6  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 366 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  34.7 
 
 		 366 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 657 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>