More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5452 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  100 
 
 		 556 aa  1110    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.81 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  30.99 
 
 		 1055 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 654 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 661 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  23.21 
 
 		 845 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  22.78 
 
 		 845 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.43 
 
 		 598 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 598 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.13 
 
 		 1070 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0727  putative signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 594 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.32 
 
 		 373 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  34.48 
 
 		 525 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  29.26 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 658 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 1211 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 1116 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5143  putative integral membrane sensor protein  30.62 
 
 		 479 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 541 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 1211 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.7 
 
 		 456 aa  104  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.27 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.27 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  31.78 
 
 		 415 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 694 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 575 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.6 
 
 		 456 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 616 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  30.15 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 614 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  31.63 
 
 		 632 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4638  putative two-component histidine kinase  34.07 
 
 		 243 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.032763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.63 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 514 aa  100  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 700 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 700 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 658 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 370 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  32.08 
 
 		 309 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 700 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  29.72 
 
 		 740 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 489 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 535 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 684 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 707 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 552 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 372 aa  97.4  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5069  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 748 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  30.39 
 
 		 830 aa  97.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 660 aa  96.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  28.07 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 384 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 673 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 703 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 394 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 382 aa  95.9  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  30.88 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.17 
 
 		 482 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 703 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  33.16 
 
 		 1809 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.09 
 
 		 325 aa  95.1  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  29.18 
 
 		 594 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  28.57 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  29.83 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 479 aa  94.4  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 445 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2624  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 744 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 381 aa  94  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 591 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 468 aa  93.6  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 662 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 439 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3479  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 744 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  27.83 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  26.13 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  28.16 
 
 		 662 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 485 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  29.88 
 
 		 387 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  30.55 
 
 		 664 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  25.94 
 
 		 392 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 770 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  30.35 
 
 		 464 aa  92  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  32.42 
 
 		 592 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  28.3 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 475 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  30.58 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 548 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>