More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1550 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 350 aa  699    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 661 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 654 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 660 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 658 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 560 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0727  putative signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 476 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 556 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  35.58 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  32.67 
 
 		 270 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 614 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 546 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  26.52 
 
 		 373 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 694 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  31.42 
 
 		 461 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4638  putative two-component histidine kinase  36.12 
 
 		 243 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.032763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 466 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  33.33 
 
 		 515 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 425 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  28.86 
 
 		 683 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 682 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 603 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.98 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  30.45 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 795 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 748 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  29.39 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 795 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  30.61 
 
 		 474 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 462 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 466 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 462 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 401 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0502  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.14 
 
 		 705 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  33.47 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 526 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 795 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  30.83 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 544 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 		 463 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 		 463 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  27.91 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  28.46 
 
 		 525 aa  90.5  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 541 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 490 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.89 
 
 		 739 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.498595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  32.1 
 
 		 463 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 362 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 352 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  30.92 
 
 		 632 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  27.5 
 
 		 668 aa  89.4  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 1226 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  28.91 
 
 		 475 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  29.95 
 
 		 1101 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  31.38 
 
 		 653 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  28.57 
 
 		 485 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 585 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 456 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.74 
 
 		 466 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 466 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 485 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 545 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  27.92 
 
 		 518 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 466 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  30.54 
 
 		 671 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  34.35 
 
 		 418 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 484 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 624 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 513 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 545 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>