More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1950 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 421 aa  816    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.18 
 
 		 424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.85 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  55.94 
 
 		 216 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.24 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  38.39 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  31.5 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  35 
 
 		 488 aa  127  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.58 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 513 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 682 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.98 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.84 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  29.74 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 472 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.11 
 
 		 479 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  30.69 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 661 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  36.03 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 671 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  33.71 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.35 
 
 		 683 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  33.48 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 573 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 552 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 654 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  30.33 
 
 		 468 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  36.32 
 
 		 514 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  35.22 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.71 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 475 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  28.42 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.92 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  28.32 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  35.19 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  32.3 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.71 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 492 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  34.11 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.51 
 
 		 515 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.91 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 700 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  32.89 
 
 		 619 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  30.96 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  32.89 
 
 		 680 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  32.49 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  31.54 
 
 		 687 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  33.89 
 
 		 689 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 703 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2419  histidine kinase  40.91 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.437374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 703 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 700 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 700 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  34.98 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 485 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  31.49 
 
 		 527 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 485 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  34.95 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  36.6 
 
 		 501 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  34.4 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>