More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_38910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  100 
 
 
216 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.94 
 
 
421 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.9 
 
 
424 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.9 
 
 
425 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.41 
 
 
424 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
513 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
573 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.36 
 
 
466 aa  118  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
509 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
350 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
541 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  37.06 
 
 
514 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  32.68 
 
 
447 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
526 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
513 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  40.3 
 
 
422 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.63 
 
 
466 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  35.02 
 
 
680 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
366 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
795 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
795 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
541 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
692 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  38.24 
 
 
493 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  34.58 
 
 
619 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
443 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0719701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
801 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  33.85 
 
 
525 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
546 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
795 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  34.58 
 
 
680 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  37.38 
 
 
381 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  31.53 
 
 
456 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
661 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
412 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
363 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
748 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  39 
 
 
325 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  34.6 
 
 
439 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
1168 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
552 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
370 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
799 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
553 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  38.07 
 
 
338 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  32.69 
 
 
458 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
654 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.84 
 
 
451 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
489 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 
795 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.24 
 
 
683 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 
687 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
519 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
1168 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
485 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
560 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.01 
 
 
430 aa  99  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  33.81 
 
 
671 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  33.81 
 
 
670 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
472 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  32.34 
 
 
451 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
407 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  32.2 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
521 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32.98 
 
 
1809 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  37.31 
 
 
368 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  26.54 
 
 
395 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.69 
 
 
373 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
464 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
439 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  37.13 
 
 
356 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  33.65 
 
 
527 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  34.29 
 
 
797 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  33.49 
 
 
410 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  33.49 
 
 
830 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
703 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.61 
 
 
387 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.46 
 
 
515 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  30.29 
 
 
497 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  33.65 
 
 
547 aa  95.1  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  36.02 
 
 
413 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  35.29 
 
 
404 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
682 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
385 aa  94.7  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  34.02 
 
 
594 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
684 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
707 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
381 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
298 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  35.68 
 
 
313 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
384 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
703 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
333 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  34.31 
 
 
461 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.02 
 
 
448 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
352 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
638 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
384 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.17 
 
 
799 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
456 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>