More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0744 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.07 
 
 		 658 aa  822    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 660 aa  1358    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 694 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1545  histidine kinase  27.98 
 
 		 708 aa  253  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00108525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 641 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 654 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  23.08 
 
 		 654 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  23.22 
 
 		 1018 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 350 aa  121  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 		 645 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  23.05 
 
 		 1016 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  24.93 
 
 		 787 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 614 aa  111  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.33 
 
 		 466 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  34.27 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  25.62 
 
 		 1022 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 684 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 707 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 703 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  30.66 
 
 		 270 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 448 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 461 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 703 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 486 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 466 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  35.65 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 615 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.45 
 
 		 456 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4638  putative two-component histidine kinase  32.59 
 
 		 243 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.032763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  26.44 
 
 		 392 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 462 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 462 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 459 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  32.65 
 
 		 830 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2585  methyl-accepting chemotaxis domain/unknown domain-containing protein  22.93 
 
 		 775 aa  99.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000884798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  29.91 
 
 		 373 aa  99.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 468 aa  98.6  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  31.62 
 
 		 710 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  31.62 
 
 		 710 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  32.16 
 
 		 740 aa  98.6  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 645 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 624 aa  98.2  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 446 aa  97.8  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 575 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 556 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0727  putative signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 490 aa  97.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 446 aa  97.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  31.95 
 
 		 575 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  32.37 
 
 		 575 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  31.62 
 
 		 475 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  30.86 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 700 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  30.69 
 
 		 287 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  34.3 
 
 		 418 aa  95.1  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 477 aa  94.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 603 aa  94.4  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 451 aa  94  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 370 aa  94  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 359 aa  94  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 394 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 636 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  30.8 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 468 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2032  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.509946  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  29.83 
 
 		 619 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  32.89 
 
 		 293 aa  92.8  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  28.35 
 
 		 497 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 363 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 446 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 478 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  28.45 
 
 		 683 aa  91.3  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  28.51 
 
 		 687 aa  91.3  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  29.28 
 
 		 461 aa  91.3  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  29.83 
 
 		 680 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  29.83 
 
 		 680 aa  91.3  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  25.05 
 
 		 636 aa  90.9  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>