More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1633 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 636 aa  1246    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  30.99 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  28.6 
 
 		 657 aa  191  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.4 
 
 		 626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 645 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  28.14 
 
 		 619 aa  174  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 652 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 614 aa  167  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  28.01 
 
 		 659 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 614 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 661 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 618 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 652 aa  147  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 615 aa  145  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  27.26 
 
 		 921 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  26.11 
 
 		 625 aa  127  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  36.4 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 660 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 640 aa  95.1  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 476 aa  90.9  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3119  ATPase domain-containing protein  32.72 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  34.1 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  33.33 
 
 		 643 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 401 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.95 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 658 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.04 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 352 aa  76.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  27.06 
 
 		 1063 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 801 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  27.23 
 
 		 1037 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.33 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 662 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  30.1 
 
 		 347 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  30.09 
 
 		 967 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  26.25 
 
 		 657 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  28.62 
 
 		 1031 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 694 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.83 
 
 		 325 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  27.27 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  26.19 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  28.25 
 
 		 783 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 478 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1248  signal transduction histidine kinase-like protein  29.52 
 
 		 768 aa  72.4  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.52923  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  26.86 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  26.86 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.07 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.75 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  32.79 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  29.88 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  27.98 
 
 		 637 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  30.83 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  29.39 
 
 		 671 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  26.27 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  26.6 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  31.86 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 313 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2964  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  29.63 
 
 		 564 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 775 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 489 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.51 
 
 		 392 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.44 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.36 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  30.43 
 
 		 772 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  25.69 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  29.18 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  28.74 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  33.18 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  31.36 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  26.39 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>