More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0448 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
615 aa  1248    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  54.93 
 
 
640 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  49.5 
 
 
921 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
645 aa  402  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  39.3 
 
 
626 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
636 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  25.59 
 
 
619 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
618 aa  120  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  27.27 
 
 
659 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
614 aa  110  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  25.91 
 
 
657 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
660 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
614 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  25.86 
 
 
625 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  25.62 
 
 
626 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
624 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  31.08 
 
 
501 aa  88.2  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  28.29 
 
 
657 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 
658 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 
652 aa  78.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
742 aa  77.4  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  26.51 
 
 
397 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
478 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
610 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  26.64 
 
 
673 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.64 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.54 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33.81 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
471 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4420  sensor histidine kinase  24.62 
 
 
766 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0037892  normal  0.407304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
801 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  31.82 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  29.21 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 
790 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
459 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
358 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
550 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  29.69 
 
 
799 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  33 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.04 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  32.59 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.04 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  29.88 
 
 
575 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
469 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  29.46 
 
 
575 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  29.87 
 
 
797 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  28.7 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  29.46 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
461 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  29.06 
 
 
380 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0763  sensor histidine kinase  25.39 
 
 
763 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0673199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
801 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  27.4 
 
 
643 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  28.05 
 
 
1013 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  28.43 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  27.35 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  28.98 
 
 
740 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
402 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
386 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  30 
 
 
470 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.98 
 
 
462 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
561 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  28.89 
 
 
461 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  26.38 
 
 
1031 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
665 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.37 
 
 
381 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  29.87 
 
 
493 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  28.93 
 
 
967 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  27.07 
 
 
431 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  28.92 
 
 
339 aa  65.1  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  28.37 
 
 
1037 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.88 
 
 
515 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
485 aa  65.1  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
748 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
476 aa  64.7  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
403 aa  64.3  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>