More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6208 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  100 
 
 		 657 aa  1347    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  24.87 
 
 		 637 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  23.7 
 
 		 636 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 413 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 610 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  31.03 
 
 		 347 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  32.17 
 
 		 462 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 352 aa  98.2  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 700 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 469 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4738  histidine kinase  30.04 
 
 		 264 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.977544  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 703 aa  96.3  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 703 aa  94  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1400  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 644 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.324076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 700 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 700 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 412 aa  93.6  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 372 aa  91.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  31.86 
 
 		 403 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 684 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 456 aa  90.5  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 707 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  28.72 
 
 		 1033 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 441 aa  88.6  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 345 aa  88.2  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 574 aa  87.8  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  31.49 
 
 		 458 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 615 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  30.93 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 571 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  27.54 
 
 		 1037 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 682 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  28.12 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  29.44 
 
 		 529 aa  84  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  25.56 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  27.99 
 
 		 921 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 402 aa  83.6  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1935  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.68 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  27.78 
 
 		 430 aa  83.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.64 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.64 
 
 		 593 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 568 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.19 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  30.04 
 
 		 643 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  29.7 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  29.43 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  28.86 
 
 		 954 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.64 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  28.34 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  27.98 
 
 		 482 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  30 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  27.68 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  28.34 
 
 		 680 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  28.34 
 
 		 680 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  28.02 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 464 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 567 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  30.19 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 468 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  30.81 
 
 		 626 aa  80.1  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 1648 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  27.38 
 
 		 386 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 595 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 581 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 596 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  25.31 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  28.21 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 553 aa  79  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  27.59 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  25 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.55 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  25.2 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  27.49 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 640 aa  78.2  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  29.46 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.46 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  27.98 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 742 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  33.98 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>