More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4738 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4738  histidine kinase  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.977544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  38.94 
 
 		 1037 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0374  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.61 
 
 		 703 aa  97.1  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.443509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  30.04 
 
 		 657 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  30.09 
 
 		 1017 aa  95.5  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 456 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  27.32 
 
 		 975 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  26.23 
 
 		 1036 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.64 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0721  putative signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 989 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0872972  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  27.54 
 
 		 967 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  26.23 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  30.16 
 
 		 954 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 730 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  27.73 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.51 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  29.19 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  24.31 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3069  histidine kinase  26.1 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0020907  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.2 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  19.4 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  26.61 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  27.52 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 606 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000249738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1152  putative signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  24.14 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 376 aa  72  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 359 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  23.11 
 
 		 525 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  19.38 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1223  putative signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1153  putative signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  23.5 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  26.34 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  28.91 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  24.87 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  23.74 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  25.21 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  25.65 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 661 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 404 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  25.3 
 
 		 625 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.11 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  23.87 
 
 		 683 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2636  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761488  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  26.67 
 
 		 687 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  28.91 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  24.73 
 
 		 726 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  25.78 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  24.9 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  24 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  28.49 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  24.24 
 
 		 405 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  22.32 
 
 		 397 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 413 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  25 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0210  sensor kinase protein  20.83 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 463 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 660 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  24.65 
 
 		 594 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  26.59 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  25.94 
 
 		 499 aa  65.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>