More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1265 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  100 
 
 
386 aa  770    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
390 aa  212  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
404 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
372 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
376 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
376 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  31.39 
 
 
376 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
376 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  31.58 
 
 
376 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  33.55 
 
 
359 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
359 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  32.13 
 
 
376 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
359 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  33.52 
 
 
376 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
376 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  31.01 
 
 
359 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.52 
 
 
354 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  37.81 
 
 
423 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  38.64 
 
 
399 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
393 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
363 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  39.33 
 
 
400 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  30.52 
 
 
364 aa  143  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  36.88 
 
 
383 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  41.35 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  34.55 
 
 
439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  45.81 
 
 
385 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  38.18 
 
 
363 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.24 
 
 
351 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  29.09 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.8 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  40.09 
 
 
407 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.35 
 
 
726 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  38.17 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.51 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
364 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
372 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  41.75 
 
 
381 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
418 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  37.21 
 
 
386 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
399 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  33.23 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
363 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.61 
 
 
426 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.7 
 
 
699 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  39.11 
 
 
611 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
407 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  29.11 
 
 
422 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.1 
 
 
786 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.62 
 
 
364 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
393 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.74 
 
 
370 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
425 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  45.14 
 
 
386 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  37.91 
 
 
364 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  28.97 
 
 
361 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
388 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
412 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
389 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.68 
 
 
382 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  36.27 
 
 
413 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  32.62 
 
 
378 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.33 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.97 
 
 
581 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
404 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  29.66 
 
 
405 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.06 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.7 
 
 
458 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  36.08 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1914  putative sensor histidine kinase  24.09 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.792707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.11 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  35.02 
 
 
422 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
468 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3537  sensory Transduction Protein Kinase  24.35 
 
 
332 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
398 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  32.75 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  37.44 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
392 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  23.36 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.52 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>