More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 404 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  45.09 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.03 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  42.92 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  37.09 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  42.35 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  42.79 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  37.83 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  37.2 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  39.72 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.86 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.21 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  34.34 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  36.36 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 376 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 376 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.26 
 
 		 744 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.26 
 
 		 581 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.75 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.89 
 
 		 726 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.97 
 
 		 786 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  32.2 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  34.27 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  39.82 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  39.38 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  41.76 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  34.45 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.47 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 359 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  33.19 
 
 		 386 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.69 
 
 		 699 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  36.57 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  39.18 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.59 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 434 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 234 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  31.2 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.72 
 
 		 370 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.36 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.43 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.65 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.44 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  34.67 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  28.34 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  31.63 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  25.49 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  35.21 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.39 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  36.98 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  31.91 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  30.21 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  32.99 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.34 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  29.49 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  31.77 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 612 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>