More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2064 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  100 
 
 		 400 aa  786    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  40.21 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 393 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.59 
 
 		 351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  35.14 
 
 		 386 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  35.84 
 
 		 383 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  34.76 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.78 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  41.71 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  37.07 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  38.37 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.84 
 
 		 726 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  27.27 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.87 
 
 		 786 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  43.43 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  38.16 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  40.21 
 
 		 364 aa  127  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.76 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  37.24 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  39.11 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 359 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  33.23 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  33.17 
 
 		 359 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  32.83 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 407 aa  113  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.27 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  33.22 
 
 		 611 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.53 
 
 		 699 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.29 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  33 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 372 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.04 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.74 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.39 
 
 		 581 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.16 
 
 		 744 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.72 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  32.09 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.31 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  33.17 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.11 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  26.21 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  39.87 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  32.16 
 
 		 462 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  31.06 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 421 aa  93.2  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.65 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  30.7 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  32.99 
 
 		 415 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  27.57 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.79 
 
 		 458 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  36.19 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.8 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  28.33 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  29.63 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.84 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  28.45 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 310 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.92 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  37.38 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  31.01 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>