More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0589 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  100 
 
 		 386 aa  727    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  45.54 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  35.65 
 
 		 381 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  43.95 
 
 		 439 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  43.72 
 
 		 423 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.16 
 
 		 726 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 		 420 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.42 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  38.82 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  36.62 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  43.28 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  41.18 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.37 
 
 		 786 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  40.58 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.26 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.53 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  36.62 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.86 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  37.98 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  37.91 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.19 
 
 		 581 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  38.92 
 
 		 611 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  26.73 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  41.54 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.16 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.77 
 
 		 699 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.04 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.04 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  34.51 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 441 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.25 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  34.76 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  28.42 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.8 
 
 		 430 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  28.96 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  35.27 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.68 
 
 		 744 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.44 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  28.96 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  28.96 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.74 
 
 		 442 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  28.96 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  31.78 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 363 aa  90.1  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.53 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  30.17 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  39.23 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  33.04 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.13 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 445 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  31.28 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  29.95 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16240  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.429357  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  31.92 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.76 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 612 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.63 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  30.85 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  32.06 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.2 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.84 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>