More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01310 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 421 aa  854    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  48.58 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.44 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.98 
 
 		 442 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 496 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.53 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.28 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  33.33 
 
 		 380 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  30.77 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  31.04 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  26.76 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  31.27 
 
 		 442 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  30.75 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  36.51 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  30.6 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.5 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.52 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  29.57 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  30.69 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.49 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.08 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  30.46 
 
 		 381 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  32.29 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  31.52 
 
 		 399 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  35.06 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  30.57 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  32.82 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.69 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.43 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  30.31 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.82 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  33.77 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  32.6 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  31.61 
 
 		 387 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  31.28 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  35.32 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  30.62 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.19 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  29.11 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  30.95 
 
 		 408 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 441 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.41 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  31.54 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.03 
 
 		 378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  34.93 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  27.94 
 
 		 478 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.97 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  27.95 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.67 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  32.1 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  30.35 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  28.03 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  27.31 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.17 
 
 		 392 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  30.09 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  29.75 
 
 		 410 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  35.65 
 
 		 379 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  34.5 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  31.58 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.78 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  32.97 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.5 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  30.19 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 444 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  33.91 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  26.89 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  30.08 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  30.36 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  31.6 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.01 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  26.43 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  31.54 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  28.47 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  33.21 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  25.9 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.48 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  28.86 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>