More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6406 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  100 
 
 
393 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  48.44 
 
 
408 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
405 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  45.4 
 
 
402 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  41.37 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
467 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
496 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  45.8 
 
 
393 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  44.44 
 
 
387 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.97 
 
 
414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
394 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  46.12 
 
 
381 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  39.81 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  45.68 
 
 
395 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  35.7 
 
 
405 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  40.44 
 
 
367 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  43.53 
 
 
380 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  44.34 
 
 
372 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
406 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.83 
 
 
380 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
441 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  41.22 
 
 
380 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  39.36 
 
 
430 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  33.73 
 
 
447 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
424 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  40.49 
 
 
380 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.84 
 
 
400 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.25 
 
 
399 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  39.44 
 
 
430 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.97 
 
 
443 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
382 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
444 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.3 
 
 
478 aa  143  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
441 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
500 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
420 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  42.91 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.46 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.84 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  42.41 
 
 
426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  40 
 
 
407 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.42 
 
 
357 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33 
 
 
433 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  36.6 
 
 
408 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.17 
 
 
438 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  33.24 
 
 
424 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  43.5 
 
 
414 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.5 
 
 
410 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  40.1 
 
 
462 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  36.91 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.08 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.85 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  42.4 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  39.26 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  34.88 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
398 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  38.18 
 
 
379 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
439 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  37.83 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.19 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  41.98 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  38.38 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.62 
 
 
417 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.8 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.97 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  40 
 
 
399 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  43 
 
 
416 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
407 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  36.7 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.55 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  35.79 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  39.25 
 
 
432 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  39.24 
 
 
384 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
391 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.39 
 
 
407 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.44 
 
 
392 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  43 
 
 
408 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.18 
 
 
376 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  40.1 
 
 
369 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  32.42 
 
 
397 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  41.63 
 
 
393 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
438 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.14 
 
 
371 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  42.08 
 
 
388 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  37.19 
 
 
445 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  31.6 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  37.32 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  36.33 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.19 
 
 
379 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.69 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.93 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  42.66 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
612 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>