More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3821 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  100 
 
 		 380 aa  778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  34.12 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.23 
 
 		 354 aa  204  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  34.53 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.87 
 
 		 364 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  31.92 
 
 		 422 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 376 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  29.23 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 376 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  38.97 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  29.13 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  28.94 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  30.91 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 372 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  26.56 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  25.72 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  34.81 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  34.57 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  31.72 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  33 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  32.46 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  26.04 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  26.97 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 407 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  34.12 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  28.03 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.2 
 
 		 458 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  23.63 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.61 
 
 		 726 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  28.36 
 
 		 611 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  33.49 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  32.79 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  27.57 
 
 		 786 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.18 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.54 
 
 		 699 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  30.43 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.14 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 408 aa  93.6  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 418 aa  93.2  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  25.72 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  32.13 
 
 		 619 aa  90.1  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.39 
 
 		 581 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4003  histidine kinase  33.7 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.758597  normal  0.4442 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 456 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  28.71 
 
 		 625 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.5 
 
 		 466 aa  86.3  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  32.2 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  28.57 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.8 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  26.21 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  35.54 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  31.79 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  23 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 464 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  24.93 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.37 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  26.83 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  27.49 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  31.38 
 
 		 689 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>