More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01000 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 372 aa  719    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.59 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  41.36 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  42.55 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  30.77 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  27.41 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  27.09 
 
 		 376 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  42.56 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  26.8 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  26.8 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  40.54 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  26.82 
 
 		 376 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  28.42 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.65 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  31.14 
 
 		 437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  26.96 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  26.07 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.68 
 
 		 786 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  27.68 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.81 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  39.15 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  40.54 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  40 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  33.14 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  30 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  39.88 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  35.43 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  38.22 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  33.45 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.62 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.43 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  40.65 
 
 		 699 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 397 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16240  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.429357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  20.69 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  37.13 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  27.6 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  28.5 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 425 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  42.95 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  25.28 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  34.24 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 402 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 434 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.8 
 
 		 726 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.12 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  37.8 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 451 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  27.33 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.66 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  34.01 
 
 		 527 aa  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  26.98 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.36 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.01 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.03 
 
 		 744 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  30.68 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 546 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.76 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  34.15 
 
 		 529 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.56 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 552 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.59 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 742 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>