More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1640 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 369 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  48.71 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  50.42 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  42.35 
 
 		 383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  40.52 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 376 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  36.06 
 
 		 437 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.98 
 
 		 786 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  50.96 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  38.76 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.23 
 
 		 726 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  47.91 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  29.62 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  49.51 
 
 		 386 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  45.45 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  37.31 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.26 
 
 		 426 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  36.56 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  44.08 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  48.79 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.95 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  36.32 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.7 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.62 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  39.39 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  40.72 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  34.33 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.52 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  44.14 
 
 		 699 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  30.49 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  41.5 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  46.24 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.5 
 
 		 458 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.53 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.99 
 
 		 581 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  38.98 
 
 		 611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 368 aa  112  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.55 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  25 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.63 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  46.53 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.97 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.24 
 
 		 744 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.9 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  31.33 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  37.27 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 234 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  33.92 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  36.12 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  36.15 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.42 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.16 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  33.95 
 
 		 666 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  33.5 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  36.49 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  35.53 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>