More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0405 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  100 
 
 
379 aa  723    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.84 
 
 
379 aa  598  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  45.89 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  45.41 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  46.24 
 
 
382 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.13 
 
 
392 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  36.34 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
403 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  35.43 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  43.28 
 
 
388 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  42.25 
 
 
392 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  43.33 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  45.69 
 
 
395 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
420 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.33 
 
 
381 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
394 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
601 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  31.92 
 
 
408 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  35.56 
 
 
359 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  39.23 
 
 
375 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  32.07 
 
 
430 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  40.28 
 
 
376 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.73 
 
 
442 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  42.13 
 
 
381 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  35.26 
 
 
385 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.1 
 
 
417 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  36.6 
 
 
380 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.13 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  39.81 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.07 
 
 
406 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  41.79 
 
 
351 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.13 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.77 
 
 
405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  41.09 
 
 
372 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.22 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8565  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.83 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
496 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  42.03 
 
 
397 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40.62 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  39.7 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
421 aa  116  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  31.07 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  41.21 
 
 
357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  38.68 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  38.16 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  41.03 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.65 
 
 
378 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.5 
 
 
401 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.94 
 
 
400 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  38.74 
 
 
447 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  38.74 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  31.02 
 
 
380 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  33.62 
 
 
395 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  39.09 
 
 
445 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
441 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  31.29 
 
 
433 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.2 
 
 
384 aa  112  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
440 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  39.2 
 
 
393 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  32.68 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  39.81 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  34.63 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.81 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.32 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  36.8 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.29 
 
 
370 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.18 
 
 
438 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 
430 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  33.15 
 
 
393 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  33.44 
 
 
442 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  34.86 
 
 
372 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  37.96 
 
 
370 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  34.77 
 
 
455 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  36.61 
 
 
408 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  39.3 
 
 
395 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.39 
 
 
399 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
424 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  30.12 
 
 
478 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  35.11 
 
 
367 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  30.49 
 
 
397 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  42.53 
 
 
391 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  35.89 
 
 
408 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
445 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  32.3 
 
 
399 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.86 
 
 
407 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
360 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  37.96 
 
 
407 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  34.44 
 
 
470 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21610  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
423 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  33.43 
 
 
393 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>