More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0358 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 		 364 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  48.84 
 
 		 354 aa  355  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 359 aa  332  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 359 aa  331  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  46.82 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 359 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 359 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 		 363 aa  325  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  43.06 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  33.56 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  32.16 
 
 		 380 aa  165  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  30.14 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 376 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  29.59 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  26.9 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  26.56 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  25.87 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  25.75 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  29.75 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  25.14 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  31.28 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  24.59 
 
 		 383 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  29.84 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  24.2 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  27.27 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  29.47 
 
 		 407 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  27.69 
 
 		 439 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  26.11 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  23.03 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 404 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  27.51 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  26.57 
 
 		 399 aa  92.8  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  26.12 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.32 
 
 		 426 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  27.48 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  26.24 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  26.11 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  26.49 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  29.79 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  27.46 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  26.25 
 
 		 786 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.45 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  28.11 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  24.66 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.78 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  25.82 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  27.45 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  26.16 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  23 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.02 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  25 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  27.88 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  28.14 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  24.64 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  21.59 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.53 
 
 		 726 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  22.02 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  24.13 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  27.12 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.23 
 
 		 699 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  29.53 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  27.19 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.22 
 
 		 458 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  24.44 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  27.27 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  25.37 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>