More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0768 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  100 
 
 
395 aa  773    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 
403 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 
394 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  41.98 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  40 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  44.22 
 
 
372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.2 
 
 
370 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
405 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  48.56 
 
 
380 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.7 
 
 
380 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  41.19 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  42.32 
 
 
442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  45.68 
 
 
393 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  40.48 
 
 
393 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.24 
 
 
399 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  45.45 
 
 
402 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  36.01 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  37.57 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  41.09 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  49.25 
 
 
462 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  37.5 
 
 
408 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
421 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  38.26 
 
 
428 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.75 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.5 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.04 
 
 
401 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  38.17 
 
 
375 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  41.2 
 
 
408 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  44.21 
 
 
410 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  39.3 
 
 
400 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  51.52 
 
 
351 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  39.66 
 
 
430 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  39.93 
 
 
387 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  40.23 
 
 
399 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
444 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
388 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  42.21 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.84 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.63 
 
 
438 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.98 
 
 
392 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.75 
 
 
414 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.76 
 
 
400 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  33.43 
 
 
397 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  45.23 
 
 
419 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.3 
 
 
402 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.56 
 
 
417 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.5 
 
 
392 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  35.26 
 
 
402 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.2 
 
 
357 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
441 aa  156  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  38.5 
 
 
433 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
393 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
439 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.15 
 
 
406 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  36.39 
 
 
387 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
420 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
394 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.72 
 
 
388 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  39.68 
 
 
423 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.15 
 
 
430 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
441 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  41.04 
 
 
428 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  39.05 
 
 
384 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.21 
 
 
422 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.98 
 
 
376 aa  149  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  40.36 
 
 
407 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.04 
 
 
443 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  42.13 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.5 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  46 
 
 
357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.13 
 
 
378 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
406 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 
360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  34.66 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.91 
 
 
370 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  35.53 
 
 
393 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  46 
 
 
380 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  36.25 
 
 
391 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
379 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 
398 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
382 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.27 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  43.6 
 
 
382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  42.99 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 
389 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
612 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
407 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  40 
 
 
379 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.76 
 
 
386 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
398 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
445 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  40.95 
 
 
408 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>