More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1809 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 389 aa  750    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  39.7 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 408 aa  166  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  37.89 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  41.55 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.92 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  37.24 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.15 
 
 		 426 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  37.71 
 
 		 381 aa  127  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.82 
 
 		 458 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.5 
 
 		 726 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  38.75 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 404 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.09 
 
 		 744 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  38.1 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  42.5 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  30.88 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  36.82 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  37.38 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  38.58 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  40.79 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.98 
 
 		 786 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 359 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  30.46 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  27.85 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.39 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.06 
 
 		 699 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  31.09 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.4 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  25.69 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  33.06 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  24.24 
 
 		 364 aa  96.3  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  30.57 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  33.48 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  32.8 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  34.39 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.35 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 434 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  35.65 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  37.43 
 
 		 611 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  35.84 
 
 		 363 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.62 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  29.79 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.92 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  31.43 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  23.31 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.02 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.18 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  31.96 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  34.56 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3069  histidine kinase  30.57 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0020907  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  27.59 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000249738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  30.09 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  30.99 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  33.33 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 654 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>