More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0646 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  100 
 
 
380 aa  742    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  48.85 
 
 
380 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  48.82 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  41.14 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
394 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  47.04 
 
 
372 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  48.56 
 
 
395 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
405 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.79 
 
 
442 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  44.8 
 
 
367 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  36.47 
 
 
442 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.3 
 
 
370 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.95 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  42.17 
 
 
399 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  35.04 
 
 
378 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.21 
 
 
381 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  41.04 
 
 
393 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  36.36 
 
 
392 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  44.4 
 
 
428 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.63 
 
 
417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  40.68 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  44.21 
 
 
402 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
496 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  38.28 
 
 
399 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.38 
 
 
405 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  38.43 
 
 
400 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  41.22 
 
 
393 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.23 
 
 
430 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  43.28 
 
 
462 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  40.83 
 
 
388 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.43 
 
 
402 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
441 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
393 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  42.62 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
394 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.15 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
444 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  39.38 
 
 
433 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  43.28 
 
 
443 aa  139  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.33 
 
 
430 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
445 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  33.23 
 
 
376 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  40.89 
 
 
369 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
388 aa  136  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.5 
 
 
392 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.48 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  45.81 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.35 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  39.84 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  40.57 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  35.22 
 
 
478 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
612 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
421 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  42.66 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.22 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  40.59 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.71 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  37.13 
 
 
422 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.09 
 
 
376 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.38 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
407 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.65 
 
 
386 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.9 
 
 
378 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
500 aa  129  9.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  39.23 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  42.17 
 
 
449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  34.93 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.18 
 
 
383 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
420 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.82 
 
 
357 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
424 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  37.13 
 
 
407 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.17 
 
 
400 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
379 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
420 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
360 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  33.93 
 
 
391 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  34.29 
 
 
393 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
389 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.75 
 
 
408 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40 
 
 
399 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.7 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.7 
 
 
395 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  35.32 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  35.81 
 
 
379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  32.35 
 
 
401 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  36.59 
 
 
397 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  39.81 
 
 
359 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
398 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  31.96 
 
 
424 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  39.64 
 
 
419 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>