More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8145 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
581 aa  1119    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.74 
 
 
726 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  32.76 
 
 
786 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  40 
 
 
744 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
420 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  36.59 
 
 
399 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  44.44 
 
 
423 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  32.51 
 
 
611 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  35 
 
 
405 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
418 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  37.34 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  26.93 
 
 
376 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  37 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  41.71 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
390 aa  114  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  39.48 
 
 
396 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  33.18 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  33.18 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
376 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  26.93 
 
 
376 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  27.43 
 
 
376 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  32.74 
 
 
376 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.82 
 
 
699 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.86 
 
 
426 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  32.74 
 
 
376 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
404 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  27.03 
 
 
376 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  42.78 
 
 
370 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  31.84 
 
 
376 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  35.29 
 
 
364 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
376 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
404 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  38.39 
 
 
400 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
382 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
408 aa  105  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
310 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  39.41 
 
 
386 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
372 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
399 aa  100  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  35.02 
 
 
407 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  37.07 
 
 
439 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
407 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  33.65 
 
 
437 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
369 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  39.01 
 
 
363 aa  97.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.74 
 
 
382 aa  97.1  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
388 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  36.73 
 
 
385 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  33.63 
 
 
392 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
389 aa  94.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.46 
 
 
369 aa  93.2  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
234 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.78 
 
 
458 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  27.39 
 
 
380 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
359 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
398 aa  92.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
359 aa  92  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
372 aa  90.5  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  29.03 
 
 
364 aa  90.5  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  34.31 
 
 
395 aa  90.5  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
359 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.41 
 
 
381 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.98 
 
 
391 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
359 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  31.86 
 
 
375 aa  88.2  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
363 aa  87.8  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.41 
 
 
442 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  40.4 
 
 
386 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
439 aa  87  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
372 aa  87  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
359 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
359 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.11 
 
 
351 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  31.06 
 
 
378 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  28.3 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  29.7 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
387 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  36.32 
 
 
369 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.05 
 
 
354 aa  82  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
386 aa  82  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
397 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
731 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.61 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  33.5 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  33.92 
 
 
367 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  29.19 
 
 
372 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.48 
 
 
384 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  34.09 
 
 
402 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  33.18 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  27.4 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  31.3 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  32.38 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>