More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1634 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  100 
 
 
384 aa  738    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  38.19 
 
 
381 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  50 
 
 
402 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  37.82 
 
 
405 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  41.55 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.28 
 
 
410 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
441 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  47.69 
 
 
447 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  39.13 
 
 
367 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  37.69 
 
 
400 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.69 
 
 
430 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  47.03 
 
 
392 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  40.36 
 
 
395 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.67 
 
 
442 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.07 
 
 
442 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
420 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  41.96 
 
 
433 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  39.69 
 
 
478 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.39 
 
 
407 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
496 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.03 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  47.18 
 
 
408 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  39.85 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
394 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  36.97 
 
 
422 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  42.11 
 
 
388 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.55 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.34 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  43.5 
 
 
399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.87 
 
 
408 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
406 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
445 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  39.62 
 
 
399 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
398 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
424 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  38.28 
 
 
421 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
445 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
444 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35.36 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  44.8 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.84 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  41.57 
 
 
443 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.82 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
394 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.11 
 
 
383 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  37.32 
 
 
430 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  35.67 
 
 
393 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  36.65 
 
 
393 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  45.25 
 
 
351 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.49 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  42.56 
 
 
395 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  37.01 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  44.33 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  34.01 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.65 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.69 
 
 
370 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  49.31 
 
 
393 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  45 
 
 
384 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.41 
 
 
439 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  43.3 
 
 
428 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.37 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.08 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  38.75 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  42.92 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  34.71 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
394 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.96 
 
 
380 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  40.39 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.42 
 
 
415 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  35.05 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
423 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
420 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  41.46 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.98 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  38.74 
 
 
391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  40.93 
 
 
429 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
418 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.52 
 
 
375 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  35.77 
 
 
399 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  39.91 
 
 
430 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
417 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
407 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  41.1 
 
 
426 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
401 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
416 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.2 
 
 
380 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  35.57 
 
 
424 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.41 
 
 
369 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  41.28 
 
 
445 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.19 
 
 
424 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  43.43 
 
 
357 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
391 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>