More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  100 
 
 		 364 aa  727    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  39.88 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.96 
 
 		 458 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  42.56 
 
 		 423 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  39.17 
 
 		 439 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.21 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  38.73 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  39.72 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  33.15 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.22 
 
 		 786 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  36.7 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  40.21 
 
 		 400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.74 
 
 		 391 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  43.37 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  43.64 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.12 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  39.79 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  40.41 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.27 
 
 		 726 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 393 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  29.81 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  35.05 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  33.16 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  37.79 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  35.09 
 
 		 437 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  40 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  35.23 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  32.79 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.78 
 
 		 581 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  33.82 
 
 		 611 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 399 aa  99.8  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 408 aa  99.4  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.6 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.33 
 
 		 351 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  32.78 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.37 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 		 699 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.94 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.1 
 
 		 744 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 372 aa  86.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  26.05 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  31.2 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16240  signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.429357  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  33.17 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  26.87 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  27.27 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.64 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  28.49 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.020485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  31.22 
 
 		 686 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.94 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  29.11 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  28.34 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  26.64 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.89 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  29.55 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.3 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>