More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0504 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  100 
 
 		 407 aa  787    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  51.23 
 
 		 458 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  42.8 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  37.33 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 404 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  40.95 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  36.62 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  39.33 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  40.76 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.52 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  40.62 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  35.22 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  30.62 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  36.43 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.13 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.22 
 
 		 786 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  35.82 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  42.79 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 359 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  40.49 
 
 		 386 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.03 
 
 		 744 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.08 
 
 		 699 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  34.33 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  23.48 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  41.04 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  36.68 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.38 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 359 aa  103  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.29 
 
 		 726 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  27.23 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 372 aa  99.8  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  33.49 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  30.47 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.55 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  37.17 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 310 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  30.77 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 372 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.43 
 
 		 364 aa  90.1  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.02 
 
 		 581 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.27 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  32.51 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  30.88 
 
 		 430 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  32.6 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.45 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  29.17 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  32.04 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  32.02 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  30.64 
 
 		 611 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.18 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  32.29 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  28.78 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  29.52 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  29.36 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.02 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.55 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>