More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0194 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
398 aa  750    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  41.49 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  51.3 
 
 
363 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  43.07 
 
 
396 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
393 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
399 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  46.29 
 
 
423 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  47.56 
 
 
399 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  49.07 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.84 
 
 
370 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  35.79 
 
 
437 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  37.9 
 
 
383 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  36.78 
 
 
381 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.33 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
404 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  41.99 
 
 
400 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.69 
 
 
382 aa  140  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
390 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  44.61 
 
 
385 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
404 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.19 
 
 
726 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.96 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  43.4 
 
 
439 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  43 
 
 
418 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.06 
 
 
351 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  42.98 
 
 
386 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  40.84 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  41.5 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.5 
 
 
786 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  44.93 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
388 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.51 
 
 
581 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16240  signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.429357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
421 aa  110  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
434 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  26.99 
 
 
376 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
367 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  31.58 
 
 
376 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3069  histidine kinase  32.34 
 
 
392 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0020907  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
388 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  31.39 
 
 
376 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  26.15 
 
 
376 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  26.15 
 
 
376 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.47 
 
 
699 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
392 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
376 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 
359 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  33.17 
 
 
359 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
359 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  31.53 
 
 
376 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
387 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
359 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.89 
 
 
458 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
376 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
376 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  31.6 
 
 
359 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
392 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000249738  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
408 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  31.22 
 
 
380 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.42 
 
 
354 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
372 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
389 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 
392 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.88 
 
 
401 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
359 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
368 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
359 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 
363 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
363 aa  97.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.17 
 
 
391 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
440 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.91 
 
 
364 aa  93.2  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  31.99 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  32.79 
 
 
442 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.22 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  34.13 
 
 
611 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  35.93 
 
 
422 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  31.91 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.47 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  26.32 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  33.48 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.9 
 
 
744 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  34.21 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.25 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  31.02 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  36.32 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  27.6 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.78 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>