More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
372 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  36.07 
 
 
386 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
404 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
363 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
367 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  30.75 
 
 
376 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  30.56 
 
 
376 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
376 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  27.42 
 
 
359 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
376 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
376 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  28.81 
 
 
376 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
376 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  28.49 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  28.49 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  28.49 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
376 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  28.84 
 
 
359 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
359 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.23 
 
 
354 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
372 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  36.04 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  35.77 
 
 
399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  25.75 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  22.35 
 
 
364 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  30.92 
 
 
385 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  36.51 
 
 
423 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  33.85 
 
 
400 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  42.86 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30 
 
 
401 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  28.35 
 
 
422 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  38.03 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  34.31 
 
 
437 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  37.07 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
404 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  34.28 
 
 
381 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
420 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
407 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.23 
 
 
392 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  33.1 
 
 
386 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
412 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
363 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 
369 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  33.18 
 
 
403 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  34.87 
 
 
407 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.97 
 
 
581 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
402 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
385 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
372 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.59 
 
 
786 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  33.61 
 
 
392 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
421 aa  99  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  39.89 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 
363 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  24.23 
 
 
363 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.82 
 
 
726 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  34.78 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
442 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
441 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
445 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
725 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  34.11 
 
 
439 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
601 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  36.36 
 
 
529 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
440 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
397 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
382 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.5 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  33.33 
 
 
413 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
682 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.22 
 
 
382 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  39.06 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  35.43 
 
 
671 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  33.62 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.27 
 
 
421 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
451 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.24 
 
 
426 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  30.31 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  37.88 
 
 
382 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.95 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
391 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  33.17 
 
 
413 aa  89.7  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
352 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
403 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  32.34 
 
 
426 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
411 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>