More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1768 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  100 
 
 
666 aa  1311    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  34.18 
 
 
422 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
445 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
440 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  29.59 
 
 
380 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.57 
 
 
406 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.12 
 
 
430 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  31.19 
 
 
380 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.62 
 
 
430 aa  110  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  37.67 
 
 
372 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
612 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
407 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
424 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
385 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.74 
 
 
442 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
401 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
391 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  33.5 
 
 
462 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.65 
 
 
380 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
373 aa  101  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
394 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  30.7 
 
 
393 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
405 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
404 aa  99.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  33.93 
 
 
372 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
379 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  31.78 
 
 
369 aa  98.2  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.96 
 
 
399 aa  98.2  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  36.15 
 
 
380 aa  97.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
441 aa  97.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
416 aa  97.1  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  27.22 
 
 
442 aa  97.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  31.93 
 
 
384 aa  97.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
382 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  36.32 
 
 
395 aa  95.9  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  35.54 
 
 
449 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
536 aa  95.5  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  27.78 
 
 
391 aa  95.1  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  30.58 
 
 
401 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
742 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  30.37 
 
 
417 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  32.77 
 
 
375 aa  94.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  28.99 
 
 
392 aa  94  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.46 
 
 
401 aa  94  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  35.98 
 
 
402 aa  94  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
394 aa  93.6  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
496 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
472 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39190  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
601 aa  93.2  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.240452 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
402 aa  92  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.74 
 
 
381 aa  91.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  32.27 
 
 
393 aa  91.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  31.97 
 
 
395 aa  91.3  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
438 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  35 
 
 
393 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  29.06 
 
 
399 aa  90.9  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  30.77 
 
 
376 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  33.81 
 
 
371 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.46 
 
 
400 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  30.97 
 
 
393 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  31.8 
 
 
378 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  33.95 
 
 
379 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
449 aa  89.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  35.21 
 
 
382 aa  89  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
382 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.61 
 
 
370 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
391 aa  89  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  32.91 
 
 
443 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  37.5 
 
 
555 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
450 aa  87.8  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
444 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  33.19 
 
 
394 aa  87.8  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  35.58 
 
 
389 aa  87.4  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  32.69 
 
 
380 aa  87.4  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1821  histidine kinase  30.79 
 
 
384 aa  87.4  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  0.0945618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
386 aa  87.4  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
372 aa  87  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  35.1 
 
 
493 aa  87  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.36 
 
 
393 aa  87  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  32.55 
 
 
405 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  31.56 
 
 
478 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.3 
 
 
325 aa  87  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  28.51 
 
 
399 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  32.65 
 
 
580 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  34.15 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  25.84 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.53 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  25.84 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  31.22 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
869 aa  84.7  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  32.84 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
775 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.53 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  32.74 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
388 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.62 
 
 
430 aa  84  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
438 aa  84  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>