More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4510 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  100 
 
 
408 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  46.94 
 
 
393 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.21 
 
 
405 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  48.09 
 
 
402 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
467 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  43.8 
 
 
442 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  38.3 
 
 
391 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
496 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  46.41 
 
 
387 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19750  signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
406 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
445 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.63 
 
 
414 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  36.72 
 
 
381 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  37.2 
 
 
380 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  36.36 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
444 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.95 
 
 
370 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  36.52 
 
 
372 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.59 
 
 
380 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  35.42 
 
 
393 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  33.5 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.35 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  44.77 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.5 
 
 
380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  36.34 
 
 
367 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
441 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
424 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  33.42 
 
 
433 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.5 
 
 
405 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  36.2 
 
 
399 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  41.2 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.41 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  35.36 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.04 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
441 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.75 
 
 
446 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
398 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  35.09 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  39.15 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  34.2 
 
 
392 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
421 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.57 
 
 
401 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.62 
 
 
438 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
469 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  35.76 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  37.87 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.08 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  41.63 
 
 
555 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.29 
 
 
424 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  42.01 
 
 
442 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
424 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
439 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
441 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2538  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.84 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  33.84 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  33.42 
 
 
379 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.22 
 
 
443 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  37.55 
 
 
397 aa  131  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  34.97 
 
 
388 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  39.6 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.36 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.12 
 
 
400 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  33.6 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  38.49 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  36.09 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  33.67 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  41.52 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  38.27 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.3 
 
 
422 aa  127  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
382 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
388 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  34.21 
 
 
443 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  42.13 
 
 
351 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.69 
 
 
422 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
406 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.55 
 
 
423 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  40.64 
 
 
399 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  38.44 
 
 
395 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  36.75 
 
 
380 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  43.05 
 
 
408 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.48 
 
 
407 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  42.92 
 
 
419 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.03 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  33.06 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.88 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  38.02 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  34 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  41.63 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  38.01 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
453 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  33.86 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  36 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  34.31 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  42.13 
 
 
357 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>