More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1291 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  100 
 
 		 364 aa  742    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  50.14 
 
 		 361 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  32.3 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.03 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  29.74 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  29.04 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 376 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  28.8 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 359 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  27.12 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 359 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  30.23 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 390 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  26.9 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.68 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  26.84 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  28.33 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  30.53 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  26.24 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  24.93 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  28.67 
 
 		 437 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  33.16 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  27.17 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  29.68 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  30.37 
 
 		 383 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  30.93 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 420 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  30.95 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  25.16 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  29.21 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  23.95 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  29.3 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.7 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  28.03 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  25 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  25.34 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  30.27 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.93 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  24.22 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  24.76 
 
 		 527 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  29.25 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.92 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.38 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.52 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  28.25 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.46 
 
 		 726 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 513 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  27.8 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.21 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  23.45 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  30.88 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  31.34 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  28.8 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  30.24 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  27.11 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.41 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  28.5 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 771 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.11 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.2 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>