More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1197 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
438 aa  818    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  39.01 
 
 
416 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
612 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
423 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  35.07 
 
 
455 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  42.04 
 
 
422 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  40.08 
 
 
397 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  35.99 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
441 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  43.8 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6236  histidine kinase  40.36 
 
 
387 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.39934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  38.78 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  34.25 
 
 
393 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  40 
 
 
430 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  37.74 
 
 
405 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
441 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  44.5 
 
 
419 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  41.78 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.9 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.98 
 
 
392 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
469 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  40 
 
 
428 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  40.09 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  42.5 
 
 
395 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  38.43 
 
 
380 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  43.33 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
382 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  42.11 
 
 
410 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
421 aa  126  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.91 
 
 
370 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40.7 
 
 
399 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  37.07 
 
 
445 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  41.2 
 
 
372 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  42.42 
 
 
447 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  42.23 
 
 
393 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  39.53 
 
 
420 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
394 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.53 
 
 
424 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.27 
 
 
422 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  40.55 
 
 
402 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
405 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  41.48 
 
 
423 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  38.13 
 
 
408 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  41.63 
 
 
421 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  40.84 
 
 
428 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.87 
 
 
389 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  35.47 
 
 
438 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  36.15 
 
 
430 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  37.27 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  42.57 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0276057  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.51 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  34.26 
 
 
433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  33.53 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2490  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.736306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  37.79 
 
 
387 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  40.38 
 
 
443 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
426 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  33.2 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
386 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  34.52 
 
 
399 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.11 
 
 
384 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.34 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  36.48 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.01 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  38.39 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.95 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.6 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  39.01 
 
 
402 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  39.23 
 
 
369 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  42.2 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  35.09 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  39.05 
 
 
555 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.7 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
424 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.04 
 
 
386 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  41.13 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  37.8 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  38.22 
 
 
384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  30.3 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  38.79 
 
 
442 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.44 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  31.96 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.28 
 
 
407 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>