More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0623 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  100 
 
 
527 aa  1060    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  44.64 
 
 
514 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
513 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
513 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  42.15 
 
 
525 aa  347  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
519 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  34.25 
 
 
500 aa  276  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  33.15 
 
 
513 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  33.77 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  33.77 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  34.53 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  34.53 
 
 
500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  33.77 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03494  hypothetical protein  33.77 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  34.53 
 
 
500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  33.77 
 
 
497 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  33.77 
 
 
497 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  34.53 
 
 
500 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  33.77 
 
 
497 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  34.34 
 
 
500 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  33.58 
 
 
500 aa  231  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.406028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5098  sensory histidine kinase UhpB  33.77 
 
 
501 aa  229  7e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.118457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  33.96 
 
 
499 aa  228  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  30.94 
 
 
509 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  30.75 
 
 
509 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  30.75 
 
 
509 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  34.53 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  35.77 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.73 
 
 
466 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
560 aa  123  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  36.36 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.89 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  37.33 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.89 
 
 
486 aa  114  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.46 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
552 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
439 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.09 
 
 
683 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  35.78 
 
 
451 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  32.47 
 
 
459 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
496 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  36.45 
 
 
403 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
339 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  37.27 
 
 
458 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
359 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
662 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  32.74 
 
 
482 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.49 
 
 
662 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
480 aa  107  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
485 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  36.24 
 
 
456 aa  107  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  34.25 
 
 
391 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
584 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  35.54 
 
 
485 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1168 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  34.2 
 
 
619 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  29.92 
 
 
325 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
658 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
376 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
573 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  36.32 
 
 
461 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
475 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  34.15 
 
 
464 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  34.47 
 
 
485 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  33.19 
 
 
478 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.02 
 
 
448 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  34.2 
 
 
680 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  36.33 
 
 
474 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
692 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
486 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
478 aa  104  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
370 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
447 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.66 
 
 
456 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  31.58 
 
 
452 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  33.33 
 
 
288 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  33.77 
 
 
680 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.82 
 
 
380 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
468 aa  103  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
476 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  28.89 
 
 
439 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  36 
 
 
430 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
459 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  30.38 
 
 
458 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
700 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
376 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
459 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
770 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  37.61 
 
 
460 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
446 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  31.67 
 
 
491 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
521 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  32.73 
 
 
481 aa  101  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
480 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
480 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
363 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  29.02 
 
 
783 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
490 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>