More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0437 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.84 
 
 		 513 aa  785    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 513 aa  1027    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  56.89 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  56.64 
 
 		 525 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.72 
 
 		 519 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  41.89 
 
 		 527 aa  343  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  31.19 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  35.46 
 
 		 500 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  34.99 
 
 		 500 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  35.77 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  34.99 
 
 		 500 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  34.99 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  34.79 
 
 		 500 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  34.86 
 
 		 497 aa  223  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  34.86 
 
 		 497 aa  223  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  34.86 
 
 		 497 aa  223  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  34.86 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  34.86 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  35.76 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  34.86 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03494  hypothetical protein  34.86 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5098  sensory histidine kinase UhpB  34.86 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  34.86 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  30.39 
 
 		 509 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  30.39 
 
 		 509 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  30.39 
 
 		 509 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  32.62 
 
 		 513 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.68 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.48 
 
 		 373 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.62 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  36.02 
 
 		 456 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  33.74 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.66 
 
 		 325 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 560 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 407 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  35.53 
 
 		 216 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.85 
 
 		 683 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.77 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  30.71 
 
 		 1046 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 1168 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 553 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  32.99 
 
 		 430 aa  107  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 412 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  29.68 
 
 		 402 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 384 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  31.3 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 440 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  32.16 
 
 		 366 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 521 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 799 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 700 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  31.86 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 372 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  36.36 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.9 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  33.79 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 748 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  33.48 
 
 		 687 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 366 aa  101  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 486 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.42 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 594 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4861  histidine kinase  34.42 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.164786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  33.64 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  31.1 
 
 		 556 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  33.06 
 
 		 772 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  31 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 471 aa  100  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 596 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>