More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3054 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  100 
 
 		 382 aa  760    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.47 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3069  histidine kinase  50.79 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0020907  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.79 
 
 		 392 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000249738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.53 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000812126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1152  putative signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 		 386 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1153  putative signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1223  putative signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  34.38 
 
 		 378 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  30 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  26.22 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  30.09 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  30.65 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  32.8 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.32 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  28.36 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  25.89 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  30.19 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  32.62 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  26.25 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  30.8 
 
 		 683 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.57 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  29.08 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  29.91 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  29.02 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  27.96 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  30.58 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.35 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  29.95 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.84 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  27.48 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  30.73 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  29.8 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.56 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  27.82 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  26.63 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 573 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.4 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  29.65 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  32.64 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  30.7 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  30.7 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  26.76 
 
 		 573 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  29.82 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  29.55 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 1046 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  26.83 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  31.55 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  31.5 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 665 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  31 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  27.03 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  31 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 671 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  28.04 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  23.84 
 
 		 592 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  30.68 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  26.67 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>