More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6138 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
403 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 
461 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.13 
 
 
395 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  51.51 
 
 
402 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  45.77 
 
 
429 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.74 
 
 
405 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  39.06 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  45.96 
 
 
463 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  41.3 
 
 
452 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
417 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.88 
 
 
586 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  52.48 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
428 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  48.39 
 
 
429 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  36.76 
 
 
429 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 
435 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  37.18 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.8 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
326 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  47.09 
 
 
430 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
408 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
418 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
435 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
435 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
435 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  37.56 
 
 
439 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
444 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  35.53 
 
 
433 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  42.77 
 
 
412 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  38.33 
 
 
434 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 
466 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  45.18 
 
 
489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  39.39 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.49 
 
 
433 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  45.63 
 
 
420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
432 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  36.26 
 
 
438 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.76 
 
 
375 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
624 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
445 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  35.87 
 
 
405 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.91 
 
 
415 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
445 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  50.94 
 
 
463 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
388 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
343 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  42.86 
 
 
388 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
444 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  42.63 
 
 
410 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  47.8 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
621 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  39.92 
 
 
442 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  41.67 
 
 
434 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  39 
 
 
492 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  46.38 
 
 
587 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  40.78 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.35 
 
 
508 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  49.75 
 
 
454 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  42.25 
 
 
476 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
411 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  45.67 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  35.18 
 
 
426 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
570 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  41.7 
 
 
580 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  42.4 
 
 
237 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
398 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 
431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
725 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
594 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  37.85 
 
 
419 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  42.72 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
618 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
403 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  39.23 
 
 
720 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
537 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
595 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  27.5 
 
 
287 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
401 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.38 
 
 
482 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  34.43 
 
 
483 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
469 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
576 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.35 
 
 
453 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  39.62 
 
 
451 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.92 
 
 
587 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
459 aa  94  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.02 
 
 
518 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>