More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0507 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  100 
 
 
373 aa  732    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  71.39 
 
 
421 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  58.09 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  58.65 
 
 
373 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
456 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
392 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
386 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
381 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
665 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
725 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
574 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
464 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
564 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
545 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
582 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
682 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
548 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
591 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
545 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
544 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
546 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
682 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
571 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
591 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  27.58 
 
 
372 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  27.3 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  35.07 
 
 
529 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  32.42 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  32.42 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
552 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
584 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  31.66 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  32.03 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  26.61 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
351 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
351 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
351 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
352 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
351 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  33.95 
 
 
351 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
523 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  32.56 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  37.93 
 
 
422 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
351 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  33.49 
 
 
351 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
775 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 
565 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  36.3 
 
 
573 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  31.78 
 
 
523 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  31.4 
 
 
523 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  30.24 
 
 
523 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  31.4 
 
 
516 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  31.4 
 
 
523 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  31.01 
 
 
523 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  30.24 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  34.15 
 
 
462 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
517 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  36.64 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  38.01 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  38.5 
 
 
412 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
652 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  28.68 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
412 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  35.11 
 
 
572 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  41.52 
 
 
573 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.82 
 
 
391 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  31.34 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
567 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
478 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
573 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
566 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
566 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
566 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.37 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
550 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
595 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
370 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.31 
 
 
566 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
568 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
411 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
568 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  26.3 
 
 
370 aa  111  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
568 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
700 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  37.25 
 
 
683 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>