More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0946 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  100 
 
 
536 aa  1041    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  50 
 
 
573 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.25 
 
 
573 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  45.99 
 
 
577 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 
571 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
535 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
568 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  41.73 
 
 
572 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  42.29 
 
 
591 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.15 
 
 
566 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
566 aa  323  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
567 aa  319  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
565 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
595 aa  313  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
556 aa  312  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
559 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
580 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
566 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
566 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
566 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 
588 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
592 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
575 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  37.83 
 
 
549 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
568 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
568 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
568 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  41.54 
 
 
573 aa  274  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
578 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
631 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  39.36 
 
 
578 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
571 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
535 aa  238  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
543 aa  233  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
590 aa  233  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
568 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
525 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  32.89 
 
 
543 aa  193  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  59.51 
 
 
392 aa  180  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
550 aa  163  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
456 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  33.4 
 
 
635 aa  153  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
381 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  36.68 
 
 
401 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  34.52 
 
 
385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  38.01 
 
 
373 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  31.63 
 
 
391 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
409 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 
673 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  35.02 
 
 
484 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
393 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  28.19 
 
 
377 aa  97.4  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
373 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  34.73 
 
 
795 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 
725 aa  93.2  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  27.34 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  27.34 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  27.34 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  28.12 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  27.34 
 
 
365 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  27.34 
 
 
372 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  38.93 
 
 
535 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  27.73 
 
 
372 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
517 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  26.95 
 
 
365 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  26.56 
 
 
372 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  36.68 
 
 
851 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  36.93 
 
 
828 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.1 
 
 
643 aa  84  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  28.37 
 
 
597 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
372 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.79 
 
 
598 aa  83.2  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  27.27 
 
 
547 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  31.43 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  31.43 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.43 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
682 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.43 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  31.43 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
584 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.43 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.43 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.07 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  23.26 
 
 
523 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  23.6 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  24.94 
 
 
523 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
665 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  33.49 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  30.95 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  24.94 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3119  ATPase domain-containing protein  31.43 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  26.52 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>