More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1578 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  94.41 
 
 		 573 aa  1009    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 573 aa  1122    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 571 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  50.27 
 
 		 577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 		 568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 567 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  48.66 
 
 		 572 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  49.1 
 
 		 591 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  50 
 
 		 536 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.67 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 566 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 592 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 580 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 595 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.71 
 
 		 575 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 578 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 535 aa  360  5e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  44.13 
 
 		 578 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 568 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 568 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 579 aa  346  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  45.8 
 
 		 573 aa  344  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 568 aa  343  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 631 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  40.03 
 
 		 549 aa  321  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 525 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.51 
 
 		 543 aa  308  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 544 aa  296  7e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 568 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  39.21 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 590 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 535 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  65.54 
 
 		 392 aa  210  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  34.04 
 
 		 635 aa  203  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 550 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  36.25 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 409 aa  175  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 381 aa  174  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 		 456 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  38.5 
 
 		 401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  33.6 
 
 		 385 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  35 
 
 		 851 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  36.3 
 
 		 373 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  35.09 
 
 		 828 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 665 aa  124  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 421 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 		 795 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  34.69 
 
 		 673 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  38.12 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 682 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 373 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  29.93 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 545 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 372 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  36.54 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  25.2 
 
 		 365 aa  104  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 372 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  37.85 
 
 		 535 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 372 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  24.46 
 
 		 365 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  24.4 
 
 		 372 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 464 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 391 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 377 aa  96.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 517 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 598 aa  92.8  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  30.15 
 
 		 622 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.5 
 
 		 598 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  28.09 
 
 		 622 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 566 aa  90.9  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 544 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.49 
 
 		 604 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 545 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 345 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 742 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>